湖南省农作物种质资源库由湖南省政府批准，依托于湖南省农业科学院水稻研究所，于1989年建成，是湖南省最早的中期保存植物种质资源低温低湿库。该种质库位于湖南省水稻研究所挂藏室内，占地441m2，总建筑面积800m2，设有中期库、短期库和可调库。其中，中期库用于中期贮藏种质资源，使用面积26m2，控制温度为-1±1℃、相对湿度为＜50％，设计保存年限为15年、保存容量4万份；短期库和可调库用于种质资源及育种中间材料的短期储存和分发利用，使用面积分别为51m2、70m2，控制温度为5±2℃、相对湿度为50-60％，设计保存年限为5年、保存容量8万份。
自1992年正式投入使用以来，至2013年该种质库累计低温保存来自全国23个省（市）、全球53个国家（地区）的稻种资源18738份。并根据不完全统计，累计为水稻、油菜、玉米、大豆、辣椒等湖南农作物短期保存资源、亲本及中间材料23945份次；16个省市80家科研、教学、生产、政府质监等单位分发稻种资源22438份，对缓解国家种质库的供种、繁种压力和促进湖南乃至南方水稻研究起到了重要的作用。初步建成库存水稻种质资源数据库，实现资源数据信息网络化。